حضرت امام خمینی(ره) به منظور ایجاد تحول در دانشگاه‌های ایران طی پیامی، فرمان تشکیل ستاد انقلاب فرهنگی را صادر کردند.
ایشان در بخشی از پیام خود از اعضای این ستاد خواستند تا برای برنامه‌ریزی رشته‌های مختلف و خط مشی آینده دانشگاه‌ها، بر اساس فرهنگ و ارزش‌های اسلامی اقدام کنند.
هدف اصلی از تشکیل ستاد انقلاب فرهنگی، بازسازی و دگرگون ساختن نظام آموزش عالی کشور و زدودن مظاهر فرهنگ غرب از چهره دانشگاه‌های ایران بود.
حیطه کار این ستاد که به بعدها به شورای عالی انقلاب فرهنگی تغییر نام یافت به تدریج گسترش یافت و ساماندهی امور فرهنگی جامعه را در زمینه‌های مختلف بر اساس فرهنگ غنی اسلام بر عهده گرفت.